Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms