Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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