Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNE3Q6ZMZ3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms