Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD1Q5SYB0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD1Q5SYB0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms