Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms