Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HADHQ16836 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HADHQ16836 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HADHQ16836 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HADHQ16836 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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