Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTF1Q16619 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms