Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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