Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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NTRK3Q16288 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NTRK3Q16288 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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