Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NPTX1Q15818 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NPTX1Q15818 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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