Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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