Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HNF4GQ14541 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms