Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms