Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL9A3Q14050 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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