Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms