Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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