Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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