Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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NAE1Q13564 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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NAE1Q13564 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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NAE1Q13564 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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NAE1Q13564 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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NAE1Q13564 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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NAE1Q13564 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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