Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms