Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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