Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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