Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms