Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms