Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms