Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms