Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HBA1P69905 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HBA1P69905 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HBA1P69905 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HBA1P69905 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HBA1P69905 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HBA1P69905 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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