Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms