Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTBP2P56545 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTBP2P56545 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTBP2P56545 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms