Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMP3P54852 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMP3P54852 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms