Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms