Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA2P51531 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms