Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2AP49459 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms