Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD2P43304 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD2P43304 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPD2P43304 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPD2P43304 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPD2P43304 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPD2P43304 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms