Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPB2P35606 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPB2P35606 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPB2P35606 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms