Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms