Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO1P25800 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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