Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCHP24723 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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