Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms