Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB4P16144 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms