Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT10P13645 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT10P13645 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms