Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH1P12830 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH1P12830 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH1P12830 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms