Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms