Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms