Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
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PKHD1P08F94 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PKHD1P08F94 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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