Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms