Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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