Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms