Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms