Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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