Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-1B6SEH8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms